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宏基因组

宏基因组学(Metagenomics),又称元基因组学,是以特定生境中的整个微生物群落作为研究对象,无需分离培养,直接提取环境样本DNA进行测序,研究环境微生物的群落结构、物种分类、系统进化、基因功能及代谢网络等,已广泛应用于微生物领域。
适用范围 
1. 环境领域:雾霾处理、污水治理、石油降解、酸性矿水处理及海洋环境等;
2. 生物能源:特殊功能的菌株、基因挖掘、工程菌的开发;
3. 医学领域:代谢病、肿瘤癌症等;
4. 农业领域:根际微生物与植物互作、农业耕作/施肥处理与土壤微生物群落等;
5. 畜牧领域:肠道、瘤胃(如产甲烷菌类群)与动物健康/营养消化研究等;
6. 特殊极端环境:极端环境条件下的微生物类群研究。
实验流程 


样品要求:

送样要求 环境样本:土壤:3g;粪便:200mg ;污泥/沉积物:3 g;血液:2 mL;液体:25mL。
DNA:总量 ≥ 1 μg、浓度 ≥ 10 ng/μL、1.8 < OD260/280 < 2.0。琼脂糖电泳条带清晰无显著降解。
平台选择 Illumina PE100/125/150
推荐测序量 肠道/粪便 >6G;水体6-8G;土壤/污泥 > 8G

生信分析: