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16S rDNA鉴定

16sDNA鉴定
通过DNA测序对微生物进行物种鉴定(菌种鉴定)是比传统生化鉴定更先进的鉴定方法。DNA测序不依赖菌种本身特点,对所有菌种均可使用。比传统生化鉴定更加快速,准确。
实验流程 


样品要求:

测序类型 样品要求
16S测序 常规样品2 g以上沉淀,水样10 ml以上,根据微生物丰度具体确定。DNA样品扩增结果体积≥15ul,扩增结果浓度≥10nM,且2100 峰图正常,基因组浓度大于0.05ng/ul。

生信分析:
基于目标区域的测序,检测序列丰度,以充分研究环境微生物多样性和群落结构差异性。

标准分析 解决问题
物种注释 物种注释及各物种丰度信息
α-多样性分析 微生物群落的丰富度和多样性
β-多样性分析 不同样本间的微生物群落
及各样本差异情况
多元统计分析 寻找组间具有显著差异的物种,同时可以比较组内差异和组间差异的大小,判断分组是否有意义
CCA分析 研究物种组成与环境因子间的关系
环境因子关联分析
VPA分析